Krogaarden har været vidne til alt fra festlige begivenheder til sorgfyldte søulykker, lokale og internationale krige, fannikernes frigørelse fra kongen, samt royale besøg fra fastlandet. Frem til 1912 var kroen kongeligt priviligeret, hvilket gav den nogle fornemme rettigheder, såsom tilladelse til udskænkning af spiritus og indlogering af gæster. De fine lovligheder overskyggede dog ikke pligten til at tage imod gennemrejsende landevejsryttere, der kunne nyde godt af den afgiftsfrie brændevin, øl og brød. Både den kongelige priviligering og de tilhørende pligter er historie den dag i dag, men den tilgang om, at Krogaarden er et sted, hvor alle kan og skal føle sig velkommen, er velbevaret og højt prioriteret.
Kroens 25 værelser er unikt indrettet og dekoreret til enhver smag og behov. De Tre Stuer er stedet, hvor både forretningsmanden i jakkesæt og montøren med olie på bukserne kan få frokost. Den Fine Stue er en opgradering af den tjenestelige service og formelle stemning, men nærværet og den afslappede stemning er gennemgående.
Samlet set er Krogaarden anno 2020 et sammensurium af historie og ø-kulturelle værdier, der er respektfuldt præsenteret i nyere – men Fanø-værdige rammer.